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多醣體疫苗是將去活化的肺炎鏈球菌利用化學方式把莢膜多醣純化出來當作疫苗中主要成分。PPV可以活化B淋巴細胞，但不會活化T淋巴細胞，所以誘導出來的免疫反應持續時間較短且無法產生免疫記憶，加上嬰幼兒免疫力尚未發育成熟無法有效產生抗體，因此不適用於2歲以下幼童而主要適用於老年人。
23價PPV疫苗於1983年上市（涵蓋1、2、3、4、5、6B、7F、8、9N、9B、10A、11A、12F、14、15B、17F、18C、19F、19A、20、22F、23F、33F血清型），臨床試驗顯示PPV23預防菌血性肺炎的保護效果約可達50%，但是對主要的非菌血性肺炎的預防效果則不明顯，並且也無法減低鼻咽部帶菌的情況。因此PPV23雖然較PCV涵括了更多的血清型而可以補充PCV接種後的其他血清型免疫力，但因為保護期限短，需要重複接種而導致抗體產生反應下降進而造成免疫耐受性。因此對於高風險老年及幼兒的保護力較為不足。
為了改善肺炎鏈球菌多醣體疫苗的缺點，PCV將莢膜多醣體結合上蛋白質載體形成接合型疫苗，也就是把莢膜多醣體拿來先綁上一個蛋白質讓人體的T淋巴細胞比較容易辨識，且幫助B淋巴細胞產生抗體，此種疫苗對免疫力尚未成熟的嬰幼兒最有效果，能產生持久的免疫記憶。PCV可以使鼻咽部黏膜受到免疫的保護，使肺炎鏈球菌的帶菌移生機率降低，進而減少肺炎鏈球菌的傳播。目前已發展出7價、10 價與13 價 PCV（包含1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19F、19A、23F血清型）。其中PCV7 及 PCV13 之內容物為肺炎鏈球菌莢膜多醣體結合CRM197蛋白載體形成，而PCV10則為莢膜多醣體結合protein D、diphtheria、tetanustoxoids蛋白載體形成。
只要沒有對疫苗成份過敏，PCV13是較PPV23安全且對從未施打或曾經施打過PPV23能刺激更高的免疫反應。以下是美國預防接種委員會（US ACIP）針對不同年紀施打肺炎鏈球菌疫苗的建議：
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嬰幼兒：是以施打PCV13（2劑基礎劑加上1劑追加劑），出生滿2個月施打第一劑，間隔8周施打第二劑，年滿12~15個月施打第三劑。
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成人：最佳的保護方法是聯合使用PPV23和PCV13。
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65歲以上長者：
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從未施打疫苗的長者則建議接種1劑PCV13然後間隔至少1 年以上後再接種PPV23。
2.
曾經於65歲後施打PPV23的長者則建議間隔一年後補充施打PCV13。
3.
在65歲以前就曾接種過PPV23的長者，建議與PPV23間隔1年以上接種PCV13，然後施打間隔至少1 年後補充接種PPV23，但是兩劑PPV23 應間隔至少5 年以上。
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